一個電子商務網站至少應有一臺用于存放企業網站的服務器。現在可以選擇存放網站建設的服務器種類繁多，有虛擬主機、服務器合租及整臺服務器。到底什么樣的網站適合于什么樣的服務器種類呢?定好服務器后又要選擇什么樣的機房進行托管呢?這些都是要考慮的問題。對于如何選擇網站服務器，目前有下述多種解決方案。
1.建立獨立的電子商務站點
具體地說，企業要建立一個由自己企業獨立管理的電子商務網站，需要自建機房配備專業人員，購買服務器、路由器、交換機、機房的輔助設備和網管軟件等。在服務器上還要安裝相應的網絡操作系統(如Windows 2003 Server或UNIX等)，開發使用服務程序。設定各項Internet服務功能，包括設立DNS服務器以及WWW. PTP服務器、Mail服務器。建立自己的數據庫查詢服務系統等，再向電信部門申請專線、出口等。這樣便可建立一個完全屬于企業自己的電子商務網站。
企業建立自己的電子商務網站后，可以真正控制和管理自己的網站.使用、維護起來也較方便，但是成本較高.所以，這種方案適合于對信息且和網站功能要求較高的大、中型企業。
2.選擇合適的Isp服務
ISP(Internet Service Provider)是Internet服務提供商的簡稱，是指專門從事Internet接入服務和相關技術支持及咨詢服務的公司或企業，是眾多企業和個人用戶進入Internet空間的釋站和橋梁。ISP服務商通過自己擁有的服務器和專門的線路24小時不間斷地與Internet連接，當企業需要進入Internet時，只要通過網絡連接ISP端的服務器，就可以與世界各地連接在Internet卜的計算機進行數據交換了。目前出現的第二代ISP可理解成網絡服務供應商NSP(Network Service Provider).即向用戶提供具備電信級服務質量的網絡資源租用服務。
建立自己的站點需要較大的投資，侮年的運營費用也較高，這在一定程度上制約了部分中小企業的建站進程。所以，對信息最和網站功能要求不高的中小企業也可以選擇ISP提供的比較經濟的服務器解決方案。
1)租用應擬主機
虛擬主機實際上就是在ISP的主機上租用一定的磁盤空間來安里用戶自己開發的網站。它是使用特殊的軟硬件技術，把一臺運行在互聯網上的服務器主機分成一臺臺.虛擬”的主機，每一臺虛擬主機都具有獨立的城名和IP地址，具有完整的Internet服務器(WWW.FTP. E-mail等)功能。在同一臺硬件、同一個操作系統上，運行著為多個用戶打開的不同的服務器程序，互不千擾;而各個用戶擁有自己的一部分系統資源(護地址、文件存儲空間、內存、CPU時間等)。因此Internet服務商的主機上可以同時安咒多個公司的網站。虛擬主機不是企業自己的主機。但可以和自己擁有的主機一樣使用。虛擬主機之間完全獨立，井可由用戶自行管理，在外界看來，每一臺虛擬主機和一臺獨立的主機完全一樣。
虛擬主機明顯的優點是開銷低。由于多臺虛擬主機共享一臺真實主機的資源，因此分攤到V個用戶的硬件費用、網絡維護費用、通信線路的費用均大幅度降低。而且用戶不用擔心對硬件設備的維護，基本上不需要管理和維護虛擬主機。剛起步開辦電子商務網站的公司，很適合采用租用虛擬主機的方式。在這種方式下，用戶可以通過FIP工具從虛擬主機上傳或下載文件，能很方便地在Internet上發布制作好的網頁。
2)服務器托管
服務器托管是指用戶將自己的獨立服務器寄放在互聯網服務商的機房，日常系統維護由互聯網服務商進行，服務器可以自己購買，也可以由互聯網服務商代購。
當企業對服務器要求比較高或需要獨立服務器時，虛擬服務器方案便不能滿足企業的要求。但是，獨立服務器需要專用的機房、空調、電源等硬件設施及操作系統、防火墻、電子郵件、Web Server等軟件。這些硬件、軟件需要專職維護人員及管理人員.這對企業來講是一筆巨大的開銷.采用服務器托管方式可以解決這一問題。這時用戶可獲得獨立服務器的功能，且日常軟件、硬件維護由互聯網服務商提供。
從另一個角度講，采用托管服務器方式時，用戶通過遠程控制(Remote Control)技術就可以獲得一個很高的控制權限，能夠決定服務質最和其他一些重要的問題。可以隨時監視系統資源的使用情況，在系統資源緊張而出現瓶頸的時候，可馬上根據具體情況對服務器進行升級。服務器托管不僅能夠滿足足夠多的訪問量和數據庫查詢.還能為用戶節約數目可觀的維護費用。
選擇服務器托管時要注意以下事項：
選擇技術支持能力強，可迅速為企業解決問題的服務商。有些IDC運營商的客服部和機房離得比較遠，一旦你的服務器出現遠程控制不了的問班.比如死機，客服部通過電話跟機房聯系，找到相關的人員先確認你的服務器是否在這個機房及是否出現問題。這樣本來很簡單的至新啟動機器的操作會變得很麻煩。